Qua natuur kenmerkt het eiland zich door uitersten; van rotsige kalksteengebergten tot vruchtbare groene dalen. Kleine authentieke dorpjes en grote steden wisselen elkaar af evenals de grote brede zandstranden en kleine baaien.

Het eiland kent meer dan 2000 verschillende plantensoorten, maar is voornamelijk rijk aan kruiden en geneeskrachtige planten, zoals oregano, tijm en mint.Ook groeien op Kreta verschillende bloemen, zoals tulpen en orchideeën. Dankzij het klimaat duurt de bloeiperiode meer dan 6 maanden (van maart tot september). Tot slot groeien er op het eiland verschillende Afrikaanse bomen (palmbomen, cederbomen).